Az MNB Logisztikai Központja ügyfeleit a lehető legmagasabb biztonsági követelmények mellett, erre kialakított zárt zsilipekben fogadja. A készpénz átvétele és kiadása szintén zárt, konténeres rendszerben, sztenderdizált egységekben, vonalkód-leolvasással történik. Fontos, hogy az itt üzemelő, a működést támogató informatikai rendszerek teljes egészében lehetővé teszik a papírmentesen dokumentált üzemmenetet. Ügyfeleik – vagyis a bankok és megbízottjaik a készpénzlogisztikai szolgáltatók – számára saját informatikai elszámolási rendszert működtetnek, ahol csak a megfelelő jogosultságokkal lehet tranzakciót kezdeményezni. Az értéktárolásra szolgáló, magasraktári rendszer szerint kialakított trezorban a forgalmazásra is használt bankjegyekkel telt konténerek felbontás nélkül elhelyezhetők. A tárolt készpénzállomány vonalkódolvasással is számba vehető. Az értékek szállítása önjáró, a számítástechnikai rendszerben indított parancsokkal vezérelt targoncákkal történik, a biztonságot, minden munkafolyamatra részletesen kiterjedő, modern kamerarendszer is biztosítja.

A biztonsági feltételek tekintetében lényeges szempont, hogy a Logisztikai Központban zajló munkafolyamatok legnagyobb része esetében emberi kéz érintése nélkül történik a készpénzes operáció.